O Pitágoras também oferece aos seus alunos o Financiamento Estudantil (FIES), criado pelo Governo Federal em 1999 e destinado a estudantes que não têm condições de arcar integralmente com os custos de sua formação no ensino superior. O aluno pode financiar até 50% de sua mensalidade e só começará a pagar o financiamento à Caixa Econômica Federal após a conclusão do curso.
Para participar do Programa o aluno só precisa estar regulamente matriculado em uma Instituição de Ensino Superior não gratuita.